叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
七十二症辨治方法
简介序卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七卷八卷九跋
许氏医案
针邪密要
序自序辨病源第一辨经络第二辨色第三辨脉第四辨手太阴本病症治第五辨手少阳标病第六辨手少阴标病第七辨三经标本并病第八辨救误上第九辨救误下第十辨善后第十一辨外治第十二辨禁忌第十三辨张氏无治之症第十四辨耐修药
简介卷一卷二卷三卷四卷五卷六跋
自序凡例（六则）卷一 中风门中风（类中导入）卷二 诸伤门伤寒暑（参绪论暑证）湿（湿热）燥火伤饮食劳倦虚损（传尸）卷三 寒热门发热热潮热恶寒（背恶寒）振寒战栗寒热疟厥卷三 诸气门上气郁痞满腹满水
曹序柳序缪序金序顾序自序卷上养身论运气说奇经八脉大旨六脉纲领血营气卫论君臣佐使逆从反正说吐汗下该尽治法论补泻当分缓急有无说推《内经》不宜主旺气说阳有余阴不足论病有真假辨虚损宜分阴阳施治论因病似虚因虚致
序卷上流注指微针赋流注经络井荥说平人气象论经隧周环图手太阴肺经手阳明大肠经足阳明胃经足太阴脾经手少阴心经手太阳小肠经足太阳膀胱经足少阴肾经手厥阴心包经手少阳三焦经足少阳胆经足厥阴肝经卷中井荥俞经合部分