前序序石山先生自赞卷一痈疽脉一治疮脉诀七恶五善二诸恶疮五逆三定痈死地分四背上九处不可病痈五痈发有不可治六发背治之难易七占色候生死八痈之源有五九生痈所感不同十肺肝肾痈症十一痈生原于脏腑十二辨脏腑内疮十三
卷一外治法手法总论手法释义器具总论经义击仆损伤应刺诸穴经义恶血已留复因怒伤肝经义击仆伤后入房伤脾经义击仆损伤脉色经义《灵枢经》骨度尺寸补遗卷二头面部巅顶骨囟骨山角骨凌云骨睛明骨两颧骨鼻梁骨中血堂唇口玉
序重刻序卷一升降部围药部内消部内护部卷二化毒部点头部拔毒部去腐部止痛部生肌收口部去管部膏药部卷三疔疮部喉症部诸疮部卷四疮部癣疮部痔疮部口牙部鼻耳部脚部补遗
序一序二卷一运气（上）太极图论阴阳体象五行生成数解五行统论每日气数百刻六千分解四季日躔宿度昼夜长短刻数二十四气七十二候斗纲解十二辰次六合解二十八宿过宫歌二十八宿说中星岁差考奎壁角轸天地之门户说气数统论
序上卷背痈论肺痈论无名肿毒论对口疮论脑疽论囊痈论臂痈论乳痈论肚痈论恶疽论疔疮论唇疔论鬓疽论下卷杨梅疮论腰疽论瘰论顽疮论脚疽论痔漏论大肠痈论小肠痈论
药性赋第一章 寒性药第二章 热性药第三章 温性药第四章 平性药
汪序自序卷上病情篇第一总义热证寒证卷上治法篇第二伐毛取嚏刮法淬法刺法拓洗熨灸侦探策应纪律守险卷下医案篇第三南针梦影卷下药方篇第四药性方剂跋
序新刻药鉴卷之一寒热温平四赋，增补东垣未尽之意药性（寒门）药性（热门）药性（温门）药性（平门）新刻药鉴卷之一用药分根梢制药资水火用药丸散例解药毒法用药生熟法药性阴阳论病症标本论取方之法论各经补泻及专主
脉诀指掌病式图说
金匮要略论注