内容提要生理学合参卷一一、西医生理学脑血液皮肤消化器循环器呼吸器排泻器神经系五官器生殖器二、中医生理学五脏六腑此外病理学合参卷二一、热二、痛三、血四、呕吐五、谵语六、泻七、肿，胀八、汗九、头痛十、咳嗽
序卷上辨阴证阳证辨脉辨寒热辨外感八风之邪辨手心手背辨口鼻辨气少气盛辨头痛辨筋骨四肢辨外伤不恶食辨渴与不渴辨劳役受病表虚不作表实治之辨证与中热颇相似卷中饮食劳倦论补中益气汤立方本指朱砂安神丸四时用药加减
序自记第一种一览延龄一卷第二种橘旁杂论上卷古今医书大意不为良相愿为良医为人子者不可不知医方技中医术为要脉四时受病原委六淫相兼说用药如用兵医不尽药石治贵人有四难医家五失七情皆听命于心再论七情总由心发人病
序新刻药鉴卷之一寒热温平四赋，增补东垣未尽之意药性（寒门）药性（热门）药性（温门）药性（平门）新刻药鉴卷之一用药分根梢制药资水火用药丸散例解药毒法用药生熟法药性阴阳论病症标本论取方之法论各经补泻及专主
序凡例卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七卷八卷九卷十附录附录
简介自序凡例卷之一卷之二卷之三卷之四卷之五卷之六卷之七卷之八卷之九卷之十卷之十一卷之十二卷之十三卷之十四
医源
神农本草经赞
序叙论痈疽发背第一服药通变方第二荣卫返魂汤用敷贴温药第三冲和仙膏敷贴热药第四回阳玉龙膏敷贴凉药第五洪宝丹合用诸方第六黄矾丸柞木饮子三石散栝蒌散真君妙贴散追风丸搜损寻痛丸复煎散神锋散乌金散索血散葛根汤散
卷一 赋歌论诀秘旨保婴赋保生歌变蒸论察儿病症秘旨观形察色审病歌病源论（望闻问切）看食指定症诀（附）五指定症歌手探冷热定症诀视法视初生视周岁五视法面部察色秘旨探病秘旨推拿小儿总诀歌（附）观面部形色五脏秘