卷上第一章·外疡总论第一节·论阴证阳证第二节·论肿第三节·论痛第四节·论痒第五节·论酸楚不痛第六节·论顽木不痛第七节·论肿疡辨脓之法第八节·论脓之色泽形质第九节·论溃疡之水第十节·论溃疡之血第十一节·
重雕元刻伤寒百证歌发微论叙卷上论伤寒七十二证候论桂枝汤用赤白芍药不同论伤寒慎用圆子药论桂枝麻黄青龙用药三证论两感伤寒论伤寒以真气为主论治伤寒须根据次第论仲景缓迟沉三脉卷下论表里虚实论桂枝肉桂论滑脉论用
序录上序录下解毒服药忌食药不宜入汤酒者上石类上草木类上虫兽类玉石上品玉石中品玉石下品草木上品草木中品草木下品虫兽上品虫兽中品虫兽下品玉石三品玉石上品玉屑玉泉丹砂水银空青曾青白青扁青石胆云母朴硝硝石矾石
书《玉机微义》后序兰室集·医家十要兰室誓戒戒行吟调鼎吟风火暑湿燥寒发热腹痛头痛腰痛胁痛心痛牙疼眼目泻痢疟（又名）咳嗽吐衄血溺血下血诸气漏淋小水不禁（详淋）喉痹诸疮漏疮疥风癣痔疮疮疝香港脚转筋痿内伤痰饮
简介序卷第一卷第二卷第三卷第四卷第五卷第六卷第七卷第八
脉诀考证
首序自序性命篇上性命篇下补遗篇一补遗篇二辟邪篇太极图说注解序周子太极图（缺）无极而太极后跋
序小引揉积论综概晒说跋
医源
原序卷之一一·条令二·检覆总说上三·检覆总说下四·疑难杂说上卷之二五·疑难杂说下六·初检七·覆检八·验尸九·妇人附·小儿尸并胞胎十·四时变动十一·洗罨十二·验未埋瘗尸首十三·验坟内及屋下攒殡尸十四·验