序一序二序三序四伤寒十六证类方自叙伤寒证六经提纲太阳经提纲太阳经坏病提纲太阳经坏病结胸痞证提纲阳明经提纲阳明经虚证提纲少阳经提纲少阳经坏病提纲少阳经坏病结胸痞证提纲太阴经提纲少阴经提纲厥阴经提纲伤寒十
卷上论疮肿诊候入式法论荣卫色脉参应之法论持手诀消息法论三部所主脏腑病证论脉证名状二十六种所主病证论三部脉所主证候论三部脉所主杂病法诀论诊候肺疽肺痿法论将护忌慎法论疮疽肿虚实法辨疮肿浅深法辨脓法辨疮疽疖
序一序二卷上疗发背痈疽灸法用药第一痈疽备论第二痈疽灸法论第三骑竹马灸法第四论隔蒜灸得效第五背疽肿漫寻头灸法第六蒜饼施用分其轻重第七灸法要论第八痈疽灼艾痛痒论第九脑疽灸法第十痈疽既灸服药护脏腑论第十一马
自序卷一证治总论气血精神论升降出入论承制生化论虚实补泻论卷二上形气类三阴三阳名义一三阴三阳名义二三阴三阳名义三高骨大骨非一骨也三焦水道膀胱津液论饮入于胃游溢精气上输于脾脾气散精上归于肺通调水道下输膀胱
自序卷之一·治法通论卷之一·调经门经候总论经闭血崩赤白带下白浊白淫卷之二·杂症门上（杂证男女一也。此二卷方论，出女科书，多杂病书所遗，故存之耳。）虚劳客热寒热恶寒中风飞尸血厥螈颤振惊悸颠狂血风烦闷血风
卷上勿药须知疗心法言林鉴堂安心诗养心说养肝说养脾说养肺说养肾说斋说食忌说食饮以宜居室安处论居处宜忌说寝室宜忌说卧时祝法睡诀孙真人卫生歌真西山卫生歌养神气铭孙真人养生铭谨疾箴导引却病法内养下手诀运气法固
序卷一脉诀辨惑论脉赋诊脉入式歌卷二心脏歌心脉见于三部歌心脉歌肝脏歌肝脉见于三部歌肝脉歌肾脏歌肾脉见于三部歌肾脉歌肺脏歌肺脉见于三部歌肺脉歌脾脏歌脾脉见于三部歌脾脉歌卷三七表八里脉总论七表脉交变略例论浮
颅顖经
《评琴书屋医略》提要自叙凡例序附诗并各题赠卷一外感症春日外感夏日外感秋日外感冬日外感春温症(冬温同论症治)暑症附案(暑邪变疟)湿症泄泻症痢症附论时行传染二症疟症附案(暑邪变疟)又案(疟后辨寒热)卷二消
自序序论脏象论经络次序论经络浅深论奇经八脉论总论宗气论营气论卫气论脉诀论病因论中风论八风论轻重论寒热论证候论风脉论治法论药饵附案